Muzeum znajduje się na terenie Kampinoskiego Parku Narodowego, lasu brzozowo-sosnowego, w którym w latach 1939-1941 hitlerowcy rozstrzelali tysiące ludzi. Wkrótce po wojnie utworzono tam cmentarz, na którym ponownie pochowano ciała ofiar. Znajdujące się obok muzeum poświęcone jest zarówno kronice terroru, jak i historii powstania pomnika.
Budynek położony jest w naturalnym otoczeniu: odległość od elewacji do lasu nie przekracza 12 m. Drzewa były nawet dozwolone wewnątrz budynku: w hali wystawienniczej posadzono sosny w okrągłych przeszklonych dziedzińcach-świetlikach. Teren ekspozycyjny nie ma jednak okien, a przeszklenia panoramiczne rozmieszczone są tylko od strony cmentarza, gdzie znajduje się główne wejście: stamtąd widać pomnik - trzy krzyże.
Ściany z surowego betonu definiują zarówno wnętrze, jak i zewnętrzną stronę budynku, chociaż są częściowo pokryte stalą corten na zewnątrz. Muzeum znajduje się między parkingiem a cmentarzem, jest więc również ścieżką do pomnika, która biegnie między boczną elewacją budynku a wysokim murem oporowym z betonu, który wzmacnia zbocze.
N. F.
