Centrum Bioróżnorodności Naturalis jest spadkobiercą Muzeum Historii Naturalnej, założonego na rozkaz króla Holandii Willema I w 1820 roku, które od tego czasu przeszło kilka przekształceń, z których główna miała miejsce na początku lat 2010: Muzeum Zoologiczne im. Uniwersytet w Amsterdamie i Narodowy Zielnik, jeden z największych na świecie. W rezultacie powstało centrum edukacyjno-badawcze, którego kolekcja (42 miliony pozycji) jest jedną z pięciu największych kolekcji nauk przyrodniczych na naszej planecie.
W tym samym czasie popularność „Naturalis” wśród ogółu społeczeństwa tylko wzrosła, z 400 000 ludzi rocznie, więc budynek, który został otwarty w 1998 roku, musiał zostać szybko rozbudowany i odbudowany. Architekci Neutelings Riedijk umieścili w centrum obszerne atrium, które łączy istniejące pomieszczenia magazynowe i administracyjne z nowym muzeum i nowoczesnymi laboratoriami dla ponad 200 badaczy. Całkowita powierzchnia placówki to 38 000 m2, z czego 18 000 m2 to przebudowa, a 20 000 to nowe budownictwo.
Fasada atrium to betonowa, ozdobna kompozycja owali i trójkątów, przypominająca strukturę molekuł. Ten sam wzór jest umieszczony na podłogach. Wewnątrz jest pokryty czerwonym trawertynem, przeplatany 263 betonowymi panelami zaprojektowanymi przez projektantkę mody Iris van Herpen. Białemu betonowi nadano gładkość jedwabiu, aby przywołać futurystyczne sukienki van Herpen, a wzory są inspirowane przedmiotami z kolekcji Naturalis. Ta sama struktura w paski znajduje się na elewacjach budynku.
Wraz z lśniącymi kryształami trawertynu, białe panele tworzą wrażenie kontrastujących warstw skał. Podobieństwo potęguje zwężająca się ścieżka biegnąca przez atrium - od sali wystawowej i laboratoriów na parterze po galerie na piętrze.
Atrium zdobią również prace projektanta Torda Boontje. Zwykle zajmuje się meblami, lampami i wzorzystymi tkaninami, a dla Naturalis wykonał prawie sto paneli ściennych „o cudach natury”, łącząc motywy graficzne i fotograficzne.
