Kompleks biblioteczny przy Madison Avenue kształtował się przez prawie 100 lat: główny budynek w stylu renesansowym pojawił się w 1906 roku, lakoniczny nowy budynek został dobudowany w 1928 roku, aw latach 1991-1994 zbudowano pozbawione twarzy szklane atrium. Obejmuje również mieszczącą się w pobliżu miejską rezydencję założyciela biblioteki Johna P. Morgana, obecnie zajmowaną przez biura.
Atrium lat 90. padło ofiarą przebudowy dokonanej przez Renzo Piano, która obejmuje nową fasadę główną, hol wejściowy, centralne atrium, nową czytelnię na trzecim piętrze, galerię rękopisów i autografów, a także podziemia lokale: komórka lokatorska na 350 000 lokali magazynowych, sala koncertowo-wykładowa na 280 osób oraz kolejna nowa galeria.
Zasadniczo wszystkie nowe konstrukcje szklane i stalowe są skoncentrowane w wolnej przestrzeni między istniejącymi budynkami. Są oddzielone od poprzednich budynków paskami szkła, dzięki czemu piesi mogą patrzeć z ulicy wewnątrz budynku na jego dziedziniec.
Nowa elewacja jest pokryta kremową stalą (pasującą do marmuru z lat 20. XX wieku), a dolna część jest w pełni przeszklona. Wchodząc, zwiedzający przechodzi przez niski hol pod kubaturą czytelni i wchodzi do atrium ze szkła i białej stali z podłogami z drewna wiśniowego. Stamtąd można dostać się do wszystkich sześciu galerii wystawowych oraz do samej biblioteki Morgan. Z przezroczystej tylnej ściany roztacza się widok na miasto.
Podobnie jak w przypadku wszystkich dodatków Piano, sufit atrium jest szklany, ale aby zapobiec uszkodzeniu eksponatów przez światło słoneczne, sufity są uzupełnione metalowymi żaluzjami i markizami z włókniny.
Na szczególne wyróżnienie zasługuje podziemna sala widowiskowa: jej ściany wyłożone są wiśnią, a krzesła obite jasnoczerwoną tkaniną.
Dawne gniazdo rodziny Morgan zostało przekształcone przez Renzo Piano z biurowca w pełnoprawną część kompleksu bibliotecznego: znajduje się tam restauracja i sklep muzealny.
Remont trwał trzy lata i kosztował 102 miliony dolarów. W rezultacie powierzchnia wystawiennicza podwoiła się, a łącznie 7000 mkw. m nowej przestrzeni.
