Austriaccy architekci wygrali konkurs na ten projekt już w 2001 roku, a jego realizacja nie była łatwa: proces budowy został przerwany na dwa lata, a jego pierwsza faza obejmowała wyłącznie wykonanie fundamentu palowego (łączna długość wbijanych pali to 536 m). Były konieczne, ponieważ muzeum powstało na słabym gruncie przybrzeżnym - u zbiegu Rodanu i Sony. Confluence oznacza „scalanie”; jest to również nazwa całego obszaru przylegającego do „strzałki” (point de confluence, „point of confluence”).
Muzeum jest ważnym budynkiem w skali miasta: jego wyróżniająca się lokalizacja sprawia, że jest „latarnią morską” i symbolem całej nowej dzielnicy Confluence - dawnego półwyspu strefy przemysłowej w pobliżu centrum Lyonu, który jest obecnie budowany instytucje, budynki biurowe i mieszkalne zaprojektowane przez wybitnych architektów.
Budynek Coop Himmelb (l) au znajduje się przy ruchliwych ciągach pieszych, dlatego aby nie stwarzać przeszkody w przemieszczaniu się mieszkańców, budynek jest wyniesiony nad ziemię, a pod nim znajduje się „plac” z restauracją.
Muzeum Confluence składa się z trzech części. „Cokół”, na którym znajduje się wspomniany „plac”, mieści dwie sale audytoryjne (odpowiednio na 327 i 122 miejsc), pomieszczenia dla uczniów pobliskich szkół, magazyny i warsztaty, sale konferencyjne. Glazed Crystal to hol ze spiralną rampą, schodami i windami oraz księgarnia. Trzecia i najważniejsza bryła to „Chmura” ze stali nierdzewnej z konstrukcją nośną, taką jak most. Istnieje 9 sal (4 na wystawy stałe i 5 na wystawy czasowe) oraz warsztaty „publiczne”; na górnym poziomie znajdują się biura administracyjne, a na dachu kawiarnia i panele słoneczne. "Latające" ramiona wspornikowe budynku inspirowane są łączącymi się obok siebie strumieniami wody.
Budżet projektu wyniósł 185 mln euro (3980 euro za metr kwadratowy).
